El Consejo Científico del CIEM lo forman actualmente:
- Eduardo Casas, Universidad de Cantabria
- Juan A. Cuesta, Universidad de Cantabria.
- Manuel de León, CSIC-ICMAT.
- Laureano González, Universidad de Cantabria.
- Tomás Recio, Universidad de Cantabria.
- Francisco Santos, Universidad de Cantabria.
- Luis Vega, BCAM.